辣椒粉，和來自新疆的甜辣椒甜椒粉，能給食品提供豐富的味道和必要的維生素，促進消化增強食欲。但是里面的微生物讓人擔心，為些提出了很多殺菌的方法。主流方法有：微波殺菌，輻照殺菌和蒸汽殺菌。
首推蒸汽殺菌，分兩種，一種是殺菌罐，一種是連續(xù)蒸汽殺菌。連續(xù)蒸汽殺菌設(shè)備多為國外進口，專門針對辣椒粉、甜椒粉殺菌，既可以殺菌，還能盡可能保持原有色澤，增加香味，殺菌成本也是的。
輻照殺菌效果較
**，但是輻射會打斷大分子鏈，有輻射殘留，大劑量還會改變產(chǎn)品的色澤，在歐盟、日本等國家嚴禁用來生產(chǎn)食品，但是可以用于寵物食品。
還有微波殺菌，有一定殺菌效果，并且可以用來烘干辣椒粉、辣椒碎，市場使用量**。
高效率滅菌
大工廠般是用南京金佰力微波殺菌法對辣椒粉殺菌，微波殺菌是通過微波溫度殺死一般**，再用脈沖針對滅殺比較難殺的**。微波殺菌法有著滅菌均勻徹底、節(jié)約能源、殺菌時間短等優(yōu)點，微波擁有穿透性，能整體平均加熱，內(nèi)外滅菌效果一致。微波電磁轉(zhuǎn)換率高，比一般加熱的電熱效率高并更加節(jié)能，滅菌時間也更短。